Phim Sóc Siêu Quậy 4 là câu chuyện tiếp nối về ban nhạc sóc chuột gồm 6 thành viên mang tên Chipmunks and Chipettes. Câu chuyện của phần 3 phim hay này xoay quanh chuyến du ngoạn trên biển của nhóm nhạc sóc chuột cùng chú quản lý Dave trước khi tham gia show diễn quốc tế. Thế nhưng, thay vì tận hưởng kỳ nghỉ 5 sao trên du thuyền sang trọng, cả nhóm sóc chuột cầm đầu là Alvin lại quậy phá gây bao thiệt hại.
Điều này khiến quản lý Dave vô cùng giận dữ, cấm túc cả nhóm trong phòng và lại càng khiến Alvin quyết tâm đào thoát. Vô tình, cậu nhóc dẫn cả nhóm đến một hoang đảo. Và tại đây, nhóm sóc chuột phải đối mặt với những nguy hiểm chưa từng trải qua.